화학 분자 구조 프로그램 Jmol 설치
Jmol: an open-source Java viewer for chemical structures in 3D
~구구절절 tmi~
오늘 이걸 하다 하루를 다 바쳤읍니다... xyz 파일을 대량으로 얻었는데 이걸 3D로 구현해보고 싶었음
근데 어제부터 아나콘다로 주피터 노트북 실행이 안되고 ... (까만창이 떴다가 사라짐)
jmol 사이트 가서 java 설치없이 프로그램 쓰는거 하려고 했는데 실행할때마다 cmd 창이 떴다 사라지니 왠지 두 일이 연관이 있는 것 같이 보였음 ㅋ ㅋ ㅋㅋ
그래서 처음에 생각한 원인 : 어제 한 윈도우 업데이트..가 문제일까?
그러나 그냥 상관없었음 주피터 노트북은 걍 아나콘다 지우고 새로 깔았더니 됐음다
그리고 jmol 프로그램 실행까지도 성공했는데 네이버에 자세한 이야기가 없길래 써봅니다
윈도우 사용자고요, 자바 설치 안되어있었습니다.
1. Jmol 다운받기
Jmol: an open-source Java viewer for chemical structures in 3D
Those with interest in molecular visualization, especially the education and research communities, are encouraged to join the jmol-users mailing list or even the jmol-developers mailing list. There you can share ideas and experiences, ask for help, give us
jmol.sourceforge.net
홈페이지 들어가서 스크롤 조금 내리면 다운로드 링크가 뜹니다. 받으면 Jmol.jar Jsmol.zip 다 들어있어요.
처음에는 자바 받기 귀찮아서 zip 파일에 든거 이것저것 눌러봤는데 자꾸 자바가 없어서 안된다는 에러가 뜨더라고요.
2. Java 깔기
https://www.oracle.com/java/technologies/javase-jdk8-downloads.html
들어가서 본인 운영체제에 맞는 파일을 다운로드 후 설치합니다... 회원가입해야함(초초초초귀찮)
yes와 next를 반복해 누르고 설치한 다음... jmol 다운받은 폴더로 갑니다...
3. Jmol 구현해보기
jmol.bat 이나 jmol.jar 파일을 실행합니다.
파일-열기로 xyz 파일 열어도 되고, 검은 화면에 드래그앤 드롭해도 됩니다.
네.. 귀엽네요
여러 기능이 있어서 구조를 바꾸거나 만드는 것도 가능한 것 같습니다. 아직 이것저것 만져보진 않아서 나중에 추가할게요....... 여튼 윈도우에 xyz 파일 가지고 계신 분들 써보세요. 그럼 끝